Munzur Üniversitesi 2008 yılında Bakanlar Kurulu kararı ile Tunceli ilinde kurulmuştur. Eski adı Tunceli Üniversitesi olan üniversite aslında ilk kez 1983-1984 öğretim yılında Fırat Üniversitesi bünyesinde Tunceli Meslek Yüksekokulu adı ile Elazığ'da öğretime başlamıştır. 1987 yılında Tunceli şehrine taşınmıştır. Toplamda 6 Fakülte, 2 Meslek yüksekokulu, 1 Yüksek Okul, 2 Enstitüden ve 5 Araştırma Merkezi bulunmaktadır. Türkiye'de ilk ve tek Alevilik Araştırma ve Uygulama Merkezi 2009 yılında bu üniversitede kurulmuştur. 

Tunceli Üniversitesi 2016 yılında Munzur Üniversitesi olarak hizmet vermeye devam etmiştir. 2014 yılında Eski Başbakan Ahmet Davutoğlu'nun ziyareti sırasında gündeme gelen isim değişikliği önerisi TBMM taraından kabul edilmiştir. 

Munzur Üniversitesi merkeze ortalama 39 km uzaklıkta bulunmaktadır.