Afyon Kocatepe Üniversitesi 1992 yılında kurulmuş ve eğitim-öğretim faaliyetlerine 1992-1993 öğretim yılında başlamıştır. Ancak üniversitenin tarihi 1974 yılında Eskişehir İktisadi ve Ticari İlimler Akademisi'nin bir kolu olan Afyonkarahisar Maliye ve Muhasebe Lisesi'ne kadar gitmektedir. Üniversite şu anda lisans düzeyinde 12 fakülte ve 4 yüksekokul, önlisans düzeyinde 15 meslek yüksekokulu, lisansüstü eğitim veren 3 enstitü ile eğitim-öğretim faaliyetinde bulunmaktadır. Afyon Kocatepe Üniversitesi için araştırma ve lisansüstü eğitim en önemli konulardan biridir. Bu faaliyetler lisansüstü enstitülerde (Fen Bilimleri Enstitüsü, Sağlık Bilimleri Enstitüsü ve Sosyal Bilimler Enstitüsü) yürütülmektedir. Üniversite ayrıca fakültelerde ve araştırma laboratuvarlarında çeşitli araştırma gruplarından oluşmaktadır. 

Şehir merkezinde iki ana kampüs bulunmaktadır. Ahmet Necdet Sezer (Türkiye Cumhuriyeti'nin Afyonkarahisar'da büyümüş eski cumhurbaşkanı) Yerleşkesi fakülte ve araştırma merkezleri olarak, Ali Çetinkaya (Türkiye Cumhuriyeti'nin kuruluşunda önemli rol oynayan siyasetçilerden biri) Yerleşkesi ise araştırma merkezleri olarak kullanılmaktadır. Sağlık Eğitimi birimleri ve Üniversite Hastanesi. Afyon Kocatepe Üniversitesi'nin 30.000'den fazla kayıtlı öğrencisi ve yaklaşık 80.000 mezunu bulunmaktadır. Afyonkarahisar'da yetişen) Yerleşkesi fakülteler ve araştırma merkezleri olarak, Ali Çetinkaya Yerleşkesi ise Sağlık Eğitim birimleri ve Üniversite Hastanesi olarak kullanılmaktadır. Afyon Kocatepe Üniversitesi'nin 30.000'den fazla kayıtlı öğrencisi ve yaklaşık 80.000 mezunu bulunmaktadır. Afyonkarahisar'da yetişen) Yerleşkesi fakülteler ve araştırma merkezleri olarak, Ali Çetinkaya Yerleşkesi ise Sağlık Eğitim birimleri ve Üniversite Hastanesi olarak kullanılmaktadır. Afyon Kocatepe Üniversitesi'nin 30.000'den fazla kayıtlı öğrencisi ve yaklaşık 80.000 mezunu bulunmaktadır.